Estudio de variantes minoritarias: Detección de subpoblaciones de virus con mutaciones de resistencia no detectables mediante métodos de secuenciación convencionales, y sus implicaciones en la elección de una primera línea de tratamiento antirretroviral, así como en la elección del régimen en sucesivos fracasos.

Resistencias en el gen de la integrasa: Detección de resistencias primarias y de mutaciones de resistencia y de polimorfismos basales mediante métodos convencionales y ultrasensibles.

Determinación genotípica del tropismo viral: Avances en la inferencia del tropismo viral mediante el estudio de la región V3 de la envuelta de VIH. Aplicación de métodos ultrasensibles de secuenciación.

Resistencias primarias y subtipos: Coordinación a nivel nacional de la vigilancia epidemiológica de las resistencias primarias y los subtipos de VIH.